《电击小子3》承接第二季剧情，电击小子继续守护着家园的安宁。然而他们不但要提升自己的能力，更要穿越时空，奋力阻止时空海盗“四圣团”作恶。在此过程中，电击小子和伙伴们凭着自身努力和各种神奇武器，实力不断提升。同时小光等人也渐渐领悟到成长的真谛，面对挫折永不放弃。电击小子等人经历了“龙城镇”与“桃花岛”的重重磨难后，一次又一次帮助人们化解危险，成功保卫了未来时空不受“四圣团”破坏。